L'uruguaiano ex Juventus era stato sospeso per aver fatto un commento razzista sul compagno di squadra Son Heung-min.
Bentancur aveva negato le accuse, ma una commissione di regolamentazione indipendente le ha ritenute fondate e il mese scorso la FA ha comminato al 27enne la sospensione e una multa di 100.000 sterline.
Gli Spurs hanno fatto ricorso, sostenendo che la sanzione era troppo "severa".
"Il ricorso è stato respinto a seguito di un'udienza e la sospensione di sette partite è stata confermata come ordinato dalla Commissione di regolamentazione", ha dichiarato la FA in un comunicato.
Bentancur salterà il quarto di finale di Coppa di Lega contro il Manchester United giovedì e la partita chiave di Premier League contro il Liverpool in casa domenica.